Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp1P52624 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp1P52624 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp1P52624 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp1P52624 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms