Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa11P50709 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa11P50709 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa11P50709 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa11P50709 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa11P50709 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa11P50709 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms