Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab21P35282 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab21P35282 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab21P35282 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms