Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pola1P33609 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pola1P33609 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pola1P33609 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pola1P33609 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pola1P33609 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pola1P33609 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pola1P33609 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pola1P33609 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pola1P33609 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pola1P33609 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pola1P33609 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms