Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SsbP32067 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SsbP32067 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SsbP32067 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SsbP32067 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SsbP32067 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SsbP32067 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SsbP32067 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SsbP32067 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SsbP32067 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SsbP32067 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SsbP32067 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SsbP32067 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SsbP32067 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SsbP32067 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SsbP32067 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SsbP32067 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SsbP32067 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SsbP32067 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SsbP32067 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SsbP32067 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SsbP32067 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SsbP32067 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SsbP32067 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SsbP32067 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms