Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsx2P31316 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms