Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc10P31257 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc10P31257 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms