Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd1P30999 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.8 ms