Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif3aP28741 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif3aP28741 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif3aP28741 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms