Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc6a9P28571 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms