Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna1P26231 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms