Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc6P23475 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms