Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PparaP23204 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PparaP23204 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PparaP23204 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PparaP23204 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PparaP23204 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PparaP23204 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PparaP23204 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PparaP23204 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PparaP23204 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PparaP23204 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PparaP23204 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PparaP23204 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PparaP23204 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PparaP23204 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PparaP23204 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PparaP23204 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PparaP23204 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PparaP23204 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PparaP23204 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PparaP23204 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PparaP23204 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PparaP23204 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PparaP23204 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PparaP23204 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PparaP23204 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PparaP23204 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PparaP23204 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PparaP23204 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PparaP23204 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms