Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefhP19246 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefhP19246 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefhP19246 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefhP19246 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefhP19246 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefhP19246 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefhP19246 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefhP19246 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefhP19246 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefhP19246 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NefhP19246 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefhP19246 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefhP19246 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefhP19246 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefhP19246 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefhP19246 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefhP19246 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefhP19246 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefhP19246 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefhP19246 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NefhP19246 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms