Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsdP18242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsdP18242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsdP18242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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