Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LdhbP16125 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LdhbP16125 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdhbP16125 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdhbP16125 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LdhbP16125 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LdhbP16125 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms