Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhoP15409 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhoP15409 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhoP15409 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhoP15409 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhoP15409 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhoP15409 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhoP15409 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RhoP15409 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RhoP15409 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhoP15409 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhoP15409 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoP15409 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoP15409 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoP15409 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoP15409 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoP15409 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoP15409 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoP15409 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoP15409 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoP15409 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoP15409 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoP15409 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RhoP15409 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoP15409 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms