Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chrm1P12657 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrm1P12657 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms