Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms