Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FlgP11088 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FlgP11088 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FlgP11088 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FlgP11088 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FlgP11088 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FlgP11088 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FlgP11088 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FlgP11088 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FlgP11088 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FlgP11088 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FlgP11088 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FlgP11088 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FlgP11088 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FlgP11088 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FlgP11088 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FlgP11088 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FlgP11088 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FlgP11088 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FlgP11088 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FlgP11088 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FlgP11088 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FlgP11088 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FlgP11088 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FlgP11088 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FlgP11088 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FlgP11088 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FlgP11088 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms