Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lynx1P0DP60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lynx1P0DP60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms