Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb2P0C1T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms