Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb1P09690 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb1P09690 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms