Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb5P09079 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb5P09079 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb5P09079 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms