Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb3P09026 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb3P09026 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms