Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2aP08775 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2aP08775 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms