Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01797 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01797 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01797 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01797 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01797 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01797 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01797 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01797 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01797 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01797 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01797 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms