Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01746 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01746 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01746 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01746 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01746 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01746 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01746 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01746 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01746 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01746 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01746 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01746 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01746 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01746 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01746 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01746 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms