Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01739 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01739 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01739 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01739 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01739 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01739 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01739 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01739 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01739 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01739 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01739 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01739 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms