Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx8O88983 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx8O88983 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx8O88983 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx8O88983 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx8O88983 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx8O88983 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms