Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lnx1O70263 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms