Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StrnO55106 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StrnO55106 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
StrnO55106 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StrnO55106 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StrnO55106 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StrnO55106 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StrnO55106 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
StrnO55106 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
StrnO55106 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
StrnO55106 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StrnO55106 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StrnO55106 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
StrnO55106 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
StrnO55106 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StrnO55106 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
StrnO55106 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
StrnO55106 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StrnO55106 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StrnO55106 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StrnO55106 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
StrnO55106 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StrnO55106 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StrnO55106 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StrnO55106 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms