Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Socs1O35716 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs1O35716 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms