Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd9O35177 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd9O35177 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms