Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr3O09116 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr3O09116 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr3O09116 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms