Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Barx2O08686 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barx2O08686 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barx2O08686 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx2O08686 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx2O08686 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms