Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r31L7N2F1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r31L7N2F1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r31L7N2F1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms