Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3099J3QPA5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3099J3QPA5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms