Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ccdc180J3QNE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ccdc180J3QNE4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc180J3QNE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ccdc180J3QNE4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms