Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms