Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200cJ3QK46 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200cJ3QK46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms