Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmigd3G3X8R9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmigd3G3X8R9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms