Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ercc6F8VPZ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ercc6F8VPZ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6F8VPZ5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms