Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4aF8VPX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4aF8VPX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms