Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pcdh9F8VPK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pcdh9F8VPK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms