Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5218F6YH22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms