Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8444F6XS56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8444F6XS56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8444F6XS56 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms