Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E130114P18RikF6S0S7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E130114P18RikF6S0S7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms