Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc146E9Q9F7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc146E9Q9F7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms