Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1iE9Q7P2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1iE9Q7P2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms